Vor dreißig Jahren landeten Außerirdische als letzte Überlebende ihrer Spezies auf der Erde. Nun wird das Raumschiff in das District 9, ein Armenviertel in Südafrika, verlegt. Heimlich versucht die MNU die außerirdischen Waffensysteme für sich zu nutzen. Allerdings sind diese an die DNA der Außerirdischen gekoppelt. Als sich die DNA eines MNU-Mannes aufgrund eines Alien-Virus verändert, gerät er auf Platz Eins der globalen Fahndungsliste.