Auf einer Insel vor der Küste Tokyos steht die Inbetriebnahme einer Boje bevor, die mit einer neuartigen Gesichtserkennungssoftware ausgestattet ist. Auch Conan und seine Freunde befinden sich - ursprünglich um Wale zu beobachten - auf der Insel. Als die Leiche eines Europol-Mitarbeiters, der im Zusammenhang mit der Boje stand, auftaucht und Conan erfährt, dass die Schwarze Organisation in den Mord verwickelt ist, beginnt er zu ermitteln.